Thần Thám Lý Kỳ xoay quanh câu chuyện của cảnh sát Lee Kei, người được giao nhiệm vụ bí mật truy tìm tên trộm mèo khét tiếng “Black Rose”, kẻ đã trốn thoát hơn hai mươi năm. Một manh mối đưa anh đến một hộp đêm, nơi anh tình cờ gặp lại bạn học cũ, Tse Sei.
Sau khi bị đe dọa đuổi việc tại đồn cảnh sát và nhà bị Hội Tam Hoàng đốt cháy, Sei giúp anh bằng cách đưa anh đến sống với chú của Sei. Tại căn hộ này, Kei gặp người hàng xóm cũ, Siu Fong-fong, và một võ sư, Cheng Po-chu.
Kei nhận ra võ thuật là một môn phái tương tự như môn phái mà “Black Rose” sử dụng, anh nghi ngờ Po-chu và đồng bọn của cô có thể có quan hệ họ hàng với tên trộm mèo và quyết định theo dõi họ sát sao. Từ đây, cuộc truy tìm “Black Rose” của Kei bắt đầu trở nên gay cấn và thú vị.